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이 연구에서 흥미로운 것은, neurodevelopment를 규명한 후 다음 스텝으로 정한 것이 brain tumor연구라는 점. 꼭 neurological disorder를 연구하는 것이 아니었다. 그리고 spatial 연구는 꼭 필요한 부분이라고 생각 → 연구의 완성도를 확 높인다.

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Keynote: Futile wound healing drives ‘mesenchymal’ cell states in glioblastoma

**Sten Linnarsson, Karolinska Institute, SE**

여담) 오늘 발표하는 내용 처음 발표하는 거라 함. bioRxiv에도 없음. 요 발표의 논문 언제 나올까?

• Brain cancer
• 과거 얘기도 하겠다.

Development of single-cell omics

• 싱글셀 연구의 역사 흐름 → 15년 이상.
• 시작을 neurotrophic factor 공부로 했다
  • support neuron as they deveop + learning, memory.
  • brain so complex → 볼 수 있는게 너무 적었어.
• 포닥 안하고 유전자 발현 측정하는 기술 개발하는 회사를 차렸다 → 싱글셀. develop scRNA-seq.

• 2009: 5개정도밖에 보지 못했다. 완전 초창기 개념.

• 2011: 96개정도 세포 봄. Discovery of de novo cell type. Transcriptome → identity.

  • 백만개의 세포를 볼 수 있는 미래를 꿈꿨다.
  • Single-cell RNA-seq is to find a new “cell type”
  • 초창기 single-cell 연구에서 cell line (ES cell, Neuro 2A)을 가지고 cell type 확인 → cell type specific을 확인한 것
    • 96개 세포로 싱글셀을 했다.
  • Insensitive. 아직 완전 초기. Bulk만큼 sensitive하게 하고싶었음 → cell은 bulk만큼 molecule이 많지 않으니 당연하긴 함. 그때는 dropout에 실망했다. 그래도 Transcriptome을 보면서 누가 누군지 알 수 있어서 기뻤다.
  • “Identity dominates the signal in transcriptome.”

• 2023: Siletti et al → adult human brain atlas (with Ed Lein) / Braun et al → 1st trim. single-cell RNA-seq atlas 등. human brain deveopment → initial repertoire or neuronal cell types.

• 2024: Mannes et al. Chromatin accessibility atlas.

  • Parallel atlas. first trimester. Linnarsson 랩 논문임.

    

• 지금은 어떤 연구를?

  • Brain cancer로 focus switch.

    • Normal brain은 모았고 이제 brain cancer 본다 → apply.
    • Gliblastoma의 cellular diversity, heterogeneity.

    

    • Futile wound-healing drives ‘mesenchymal; states in glioblastoma
    • 세가지 현상 → invasive growth, necrosis, vascular proliferation.

Glioblastoma - Mystery of Tousseu’s sign

• Physician. Paris 병원. 중요한 clinical sign을 발견: OSE sign.
  • 환자가 살아있으면 body inside를 볼 방법이 없다. external signal을 보는 것이 중요.
  • 이거는 blood clot을 찾음 → 특별한 이유 없이 붓는다: undiscovered tumor의 sign일수도.
  • 이유는 모르지만 cancer (neuroblastoma) 특히 blood coagulation이 많이 발견되었음.
  • Glibolastoma → blood coagulation이 특징.