Connectomics (Casey Schneider-Mizell, Allen Brain)

<aside> 🔖

핵심: Morphology를 기반으로 정확하게 cell type identity를 정의하기.

</aside>

• Excitatory neurons → layer로 구분. Thalamus (시상, 뇌 중간) 에서 output projection으로 subcortical layer로 뻗는다.
• Inhibitory neurons → molecular identity로 구분 (SST, VIP 등)
• Patch seq → tighest link를 제공하지 못할 때도 있다.
  • Similar enough 라고 해서… 실제 similar enough가 얼마나? identity를 분명하게 정의하는가? 는 애매하다.
• Mature technique → electron microscopy.
  • But, un-specific.

MICrON

• Connectomics. Map complete cortical circuits → 82,000 neurons & 337 million synapses.

• Connectivity를 nano scale로 보면서, 전체 population에 대해 적용한다

  • Glia cell 또한 분석이 가능!

• First study → Primary visual cortex에 대해 수행해보았다.

  • Excitatory / Inhibitiroy 보고…

    

• Excitatory → dendrite에만 집중했고, inhibitory는 dendrite와 axon 모두 집중했다?

  • How does structure of inhibition relate to neuronal diversity?

• EM 데이터는 그냥 흑백 사진이다. Molecular 정보가 없다.

  • 근데 특징이 좀 있음 → interaction하는 방향이 좀 있다 (anatomical correlates via targetting properties)

    

• Dendrite → 4개의 파트로 나눔, …

• Morphology… Morphology를 봤을 때 새로운 타입의 modulating inhibitory neuron이 있는 것 같다..!

  

  

• 전체적으로 핵심은, landscape of cell type diversity를 morphology를 기반으로 구축하는 것. → Connectivity 또한 확인.

An integrated transcriptomic cell atlas of human neural organoids (Zhisong He)

<aside> 🔖

전반적으로 오가노이드 이해하는데 도움되는 강연!

</aside>